Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms