Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOT1P17174 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOT1P17174 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1P17174 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1P17174 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOT1P17174 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOT1P17174 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOT1P17174 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOT1P17174 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOT1P17174 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOT1P17174 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOT1P17174 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms