Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRAP16234 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms