Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXB3P14651 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms