Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC130P13994 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms