Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCANP13611 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCANP13611 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCANP13611 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCANP13611 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCANP13611 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCANP13611 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCANP13611 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCANP13611 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCANP13611 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCANP13611 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCANP13611 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCANP13611 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCANP13611 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCANP13611 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCANP13611 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCANP13611 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCANP13611 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VCANP13611 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCANP13611 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCANP13611 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCANP13611 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCANP13611 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCANP13611 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCANP13611 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCANP13611 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCANP13611 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCANP13611 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCANP13611 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCANP13611 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms