Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RLBP1P12271 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RLBP1P12271 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms