Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COL6A2P12110 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COL6A2P12110 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms