Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD2P0DJD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD2P0DJD1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD2P0DJD1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms