Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBBP0CG47 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBBP0CG47 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms