Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC172P0C7W6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC172P0C7W6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms