Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGAVP06756 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGAVP06756 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms