Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGF1P05230 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGF1P05230 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGF1P05230 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGF1P05230 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGF1P05230 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGF1P05230 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGF1P05230 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGF1P05230 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGF1P05230 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGF1P05230 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGF1P05230 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGF1P05230 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGF1P05230 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGF1P05230 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGF1P05230 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGF1P05230 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGF1P05230 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGF1P05230 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGF1P05230 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGF1P05230 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGF1P05230 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGF1P05230 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGF1P05230 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGF1P05230 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGF1P05230 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGF1P05230 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGF1P05230 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGF1P05230 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGF1P05230 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGF1P05230 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGF1P05230 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGF1P05230 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms