Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRM2P04554 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRM2P04554 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRM2P04554 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRM2P04554 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRM2P04554 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRM2P04554 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRM2P04554 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRM2P04554 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRM2P04554 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRM2P04554 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRM2P04554 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms