Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A1BGP04217 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A1BGP04217 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A1BGP04217 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A1BGP04217 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A1BGP04217 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A1BGP04217 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A1BGP04217 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A1BGP04217 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A1BGP04217 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A1BGP04217 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A1BGP04217 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A1BGP04217 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A1BGP04217 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A1BGP04217 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A1BGP04217 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A1BGP04217 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
A1BGP04217 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A1BGP04217 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A1BGP04217 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A1BGP04217 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A1BGP04217 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A1BGP04217 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A1BGP04217 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A1BGP04217 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A1BGP04217 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A1BGP04217 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A1BGP04217 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A1BGP04217 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A1BGP04217 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A1BGP04217 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A1BGP04217 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A1BGP04217 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A1BGP04217 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A1BGP04217 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A1BGP04217 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A1BGP04217 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A1BGP04217 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A1BGP04217 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A1BGP04217 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A1BGP04217 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A1BGP04217 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A1BGP04217 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A1BGP04217 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A1BGP04217 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A1BGP04217 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A1BGP04217 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A1BGP04217 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A1BGP04217 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A1BGP04217 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms