Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTNP04004 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTNP04004 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTNP04004 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTNP04004 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTNP04004 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTNP04004 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTNP04004 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTNP04004 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTNP04004 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTNP04004 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTNP04004 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTNP04004 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTNP04004 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTNP04004 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTNP04004 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTNP04004 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTNP04004 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTNP04004 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTNP04004 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTNP04004 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTNP04004 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTNP04004 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTNP04004 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTNP04004 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VTNP04004 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTNP04004 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTNP04004 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms