Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERPINC1P01008 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERPINC1P01008 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms