Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF1O95521 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF1O95521 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms