Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SEC31AO94979 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC31AO94979 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms