Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIOO75962 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIOO75962 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIOO75962 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIOO75962 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIOO75962 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIOO75962 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIOO75962 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIOO75962 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIOO75962 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIOO75962 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIOO75962 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIOO75962 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIOO75962 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIOO75962 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIOO75962 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIOO75962 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIOO75962 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOO75962 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOO75962 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOO75962 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOO75962 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIOO75962 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms