Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms