Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PTMA-207ENST00000440384 222 ntTSL 320.85■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.925e-8■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.922e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CNPPD1-204ENST00000453038 1154 ntTSL 220.79■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NUDT1-207ENST00000454650 822 ntTSL 220.71■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 420.68■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BRI3-204ENST00000474291 472 ntTSL 220.67■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATPAF2-201ENST00000444058 685 ntTSL 320.64■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PUS1-201ENST00000322060 1206 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.59■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PCGF6-203ENST00000490296 1868 ntTSL 220.59■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KDM5C-201ENST00000349663 548 ntTSL 420.57■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF1C-202ENST00000537450 1318 ntTSL 220.48■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CCNO-202ENST00000501463 1726 ntTSL 1 (best)20.47■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BCAP31-202ENST00000416815 688 ntTSL 520.47■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 B3GALNT2-206ENST00000494378 1869 ntTSL 220.45■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GPS1-209ENST00000578642 579 ntTSL 420.43■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FBXO24-208ENST00000488079 1630 ntTSL 1 (best)20.42■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-228ENST00000638956 2940 ntTSL 520.41■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.865e-8■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SERPINH1-213ENST00000532356 998 ntTSL 320.4■□□□□ 0.862e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.865e-8■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.852e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RANBP2-202ENST00000425282 367 ntTSL 520.34■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PAPSS1-206ENST00000512641 466 ntTSL 420.28■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PFAS-204ENST00000580251 559 ntTSL 320.27■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-224ENST00000638659 2298 ntTSL 520.23■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SLC35F2-205ENST00000532513 1028 ntTSL 520.23■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RUFY1-207ENST00000502984 658 ntTSL 320.23■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 VRK2-205ENST00000432057 1870 ntTSL 1 (best)20.22■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CBX7-206ENST00000482294 3014 ntTSL 220.21■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RAD18-202ENST00000413832 581 ntTSL 520.18■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KLHL3-206ENST00000505853 1570 ntTSL 220.17■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF1C-206ENST00000562330 1044 ntTSL 320.13■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GPS1-214ENST00000581418 580 ntTSL 220.12■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-215ENST00000638227 2489 ntTSL 520.12■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-241ENST00000639541 2967 ntTSL 520.12■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-225ENST00000483582 2467 ntTSL 1 (best)20.12■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FBXW5-205ENST00000480818 1442 ntTSL 520.09■□□□□ 0.812e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LZTR1-214ENST00000492480 695 ntTSL 320.07■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-232ENST00000639184 2844 ntTSL 520.06■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CD99-206ENST00000449611 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 520■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PAPSS1-203ENST00000504987 492 ntTSL 419.99■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMEM129-204ENST00000476253 958 ntTSL 219.99■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-227ENST00000494365 2499 ntTSL 219.95■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LRCH4-206ENST00000485583 571 ntTSL 219.94■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.782e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CAPN10-205ENST00000357048 2202 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SHC2-205ENST00000590170 816 ntTSL 519.84■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATP6AP1-208ENST00000484908 566 ntTSL 219.77■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-261ENST00000640594 2095 ntTSL 519.69■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PEX26-204ENST00000474897 2082 ntTSL 519.68■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SERPINH1-206ENST00000526242 474 ntTSL 419.67■□□□□ 0.742e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TCEA2-205ENST00000415602 726 ntTSL 319.64■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LPAR2-206ENST00000589311 355 ntTSL 419.63■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-204ENST00000412901 1354 ntTSL 219.63■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HDAC7-214ENST00000445237 364 ntTSL 419.61■□□□□ 0.732e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.732e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-237ENST00000639421 1546 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAZ-221ENST00000616020 815 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCARF1-206ENST00000573852 2698 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.722e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ABCF3-217ENST00000489719 569 ntTSL 419.52■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 EMC3-203ENST00000470827 570 ntTSL 419.51■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX10-210ENST00000591843 1073 ntTSL 519.48■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-236ENST00000639311 2347 ntTSL 519.45■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ELF2-205ENST00000420916 882 ntTSL 1 (best)19.44■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BRI3-202ENST00000456357 667 ntTSL 219.41■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GRM7-205ENST00000435689 826 ntTSL 319.36■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MUTYH-222ENST00000478796 779 ntTSL 219.36■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 172.3
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 294.8 ms