Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF253O75346 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF253O75346 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF253O75346 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF253O75346 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF253O75346 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF253O75346 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF253O75346 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms