Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR2O75167 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR2O75167 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR2O75167 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHACTR2O75167 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHACTR2O75167 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms