Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNASEH1O60930 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNASEH1O60930 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms