Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EIF5BO60841 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF5BO60841 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms