Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC22O60826 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms