Protein–RNA interactions for Protein: O60645

EXOC3, Exocyst complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC3O60645 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOC3O60645 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOC3O60645 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms