Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARCH6O60337 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCH6O60337 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms