Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLIN1O60240 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLIN1O60240 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms