Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF1CO43896 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms