Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDIL3O43854 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDIL3O43854 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDIL3O43854 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDIL3O43854 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms