Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYTH3O43739 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYTH3O43739 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms