Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRC1O43663 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRC1O43663 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRC1O43663 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRC1O43663 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRC1O43663 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRC1O43663 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRC1O43663 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRC1O43663 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRC1O43663 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRC1O43663 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRC1O43663 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRC1O43663 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRC1O43663 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRC1O43663 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRC1O43663 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRC1O43663 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRC1O43663 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRC1O43663 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms