Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC3O43617 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC3O43617 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms