Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA2O43364 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA2O43364 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms