Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREHO43280 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREHO43280 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREHO43280 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREHO43280 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREHO43280 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREHO43280 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREHO43280 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREHO43280 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TREHO43280 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREHO43280 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREHO43280 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREHO43280 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREHO43280 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREHO43280 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREHO43280 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREHO43280 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREHO43280 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREHO43280 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREHO43280 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREHO43280 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TREHO43280 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREHO43280 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREHO43280 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TREHO43280 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREHO43280 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREHO43280 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TREHO43280 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREHO43280 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREHO43280 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREHO43280 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREHO43280 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREHO43280 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREHO43280 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TREHO43280 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREHO43280 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREHO43280 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREHO43280 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREHO43280 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TREHO43280 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TREHO43280 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TREHO43280 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms