Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARPC1BO15143 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARPC1BO15143 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms