Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP290O15078 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP290O15078 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP290O15078 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP290O15078 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP290O15078 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP290O15078 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP290O15078 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP290O15078 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP290O15078 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP290O15078 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP290O15078 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP290O15078 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP290O15078 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP290O15078 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP290O15078 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP290O15078 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP290O15078 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP290O15078 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP290O15078 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP290O15078 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP290O15078 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP290O15078 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP290O15078 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP290O15078 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP290O15078 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP290O15078 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP290O15078 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP290O15078 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP290O15078 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP290O15078 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP290O15078 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP290O15078 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP290O15078 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP290O15078 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms