Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX7O00628 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX7O00628 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX7O00628 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX7O00628 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX7O00628 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX7O00628 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX7O00628 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX7O00628 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX7O00628 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms