Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ELL2O00472 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ELL2O00472 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ELL2O00472 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ELL2O00472 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ELL2O00472 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELL2O00472 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELL2O00472 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELL2O00472 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELL2O00472 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELL2O00472 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELL2O00472 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELL2O00472 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELL2O00472 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ELL2O00472 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ELL2O00472 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELL2O00472 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELL2O00472 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELL2O00472 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELL2O00472 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELL2O00472 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELL2O00472 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELL2O00472 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELL2O00472 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELL2O00472 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELL2O00472 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELL2O00472 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELL2O00472 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELL2O00472 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ELL2O00472 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms