Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TK2O00142 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TK2O00142 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TK2O00142 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TK2O00142 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TK2O00142 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TK2O00142 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TK2O00142 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TK2O00142 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TK2O00142 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TK2O00142 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TK2O00142 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TK2O00142 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TK2O00142 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TK2O00142 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TK2O00142 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TK2O00142 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TK2O00142 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms