Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QR89 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QR89 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
J3QR89 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
J3QR89 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
J3QR89 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QR89 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QR89 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QR89 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3QR89 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3QR89 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3QR89 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3QR89 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3QR89 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3QR89 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3QR89 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
J3QR89 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3QR89 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3QR89 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3QR89 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3QR89 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3QR89 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3QR89 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms