Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms