Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8VP50 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8VP50 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8VP50 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8VP50 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8VP50 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8VP50 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VP50 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VP50 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VP50 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VP50 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VP50 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VP50 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VP50 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8VP50 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8VP50 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8VP50 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VP50 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VP50 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VP50 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VP50 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VP50 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VP50 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8VP50 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F8VP50 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F8VP50 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
F8VP50 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8VP50 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8VP50 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8VP50 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8VP50 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8VP50 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8VP50 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
F8VP50 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms