Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1E9PL57 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms