Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
E9PCH4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
E9PCH4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
E9PCH4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
E9PCH4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
E9PCH4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
E9PCH4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
E9PCH4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
E9PCH4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
E9PCH4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
E9PCH4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
E9PCH4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
E9PCH4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
E9PCH4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
E9PCH4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
E9PCH4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
E9PCH4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
E9PCH4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
E9PCH4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
E9PCH4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
E9PCH4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
E9PCH4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
E9PCH4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
E9PCH4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
E9PCH4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
E9PCH4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
E9PCH4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
E9PCH4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
E9PCH4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
E9PCH4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
E9PCH4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
E9PCH4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
E9PCH4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
E9PCH4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
E9PCH4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
E9PCH4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
E9PCH4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
E9PCH4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
E9PCH4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
E9PCH4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
E9PCH4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
E9PCH4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
E9PCH4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
E9PCH4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
E9PCH4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
E9PCH4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
E9PCH4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
E9PCH4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
E9PCH4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
E9PCH4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
E9PCH4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
E9PCH4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
E9PCH4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
E9PCH4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
E9PCH4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
E9PCH4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
E9PCH4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
E9PCH4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
E9PCH4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
E9PCH4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
E9PCH4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
E9PCH4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
E9PCH4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
E9PCH4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
E9PCH4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
E9PCH4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms