Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL3A8MV65 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms