Protein–RNA interactions for Protein: A6NIV6

LRRIQ4, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ4A6NIV6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRIQ4A6NIV6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRIQ4A6NIV6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRIQ4A6NIV6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms