Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBY3A6NI87 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms